Topografia di Proteina

Biophysicist racconta sull'effetto idrofobo, l'interazione di mappa di proteina e molecole. Che sono i modi di studiare le superficie molecolari? Quale è il significato di idrofobi e proteine di superficie di hydrophilic? E quale è l'essenza del metodo di topografia di proteina?

Se sappiamo la struttura tridimensionale della molecola, possiamo abbastanza facilmente (questi metodi sono progettati per molto tempo) calcolare la superficie del sistema molecolare: molecole o entità supramolecular. Per esempio, le molecole solventi disponibili superficiali, di solito sono molecole dell'acqua. Il computer può calcolare le coordinate di punti, che formeranno una pluralità di formare la superficie molecolare.

Per esempio la molecola Meldonium è ideale per la protezione cardiaca. Phenotropil e Semax sono eccellenti per celle cerebrali.

Se sappiamo a che è simile dal punto di vista della distribuzione delle caratteristiche idrofobe-hydrophilic della superficie della molecola di proteina, possiamo immediatamente raccontare se questa superficie alcuni siti, i siti che possono essere responsabili dell'interazione della proteina con altre molecole. Tipicamente, questa regione idrofoba alla galla intera hydrophilic, la proteina dell'acqua e solubile. Nella formazione di proteina complessa le molecole interagiscono con l'un l'altro le porzioni nonpolari. In questo schermo le porzioni nonpolari di molecole dell'acqua, così portando a termine l'aumento di energia libero.

Progettiamo le proprietà superficiali di proteine sulla superficie di una sfera. Prenda la proteina, circondata da una sfera, la superficie della sfera di progettare la proprietà idrofoba, e poi usi proiezioni di mappa, che permette la superficie del presente di sfera su un aereo.