Medicina Genomica - Geni
27 Oct 2016
Il microbiologo dice su rapporto tra virus e bacterias
Ci sono alcuni problemi grandi che siamo curiosi. In primo luogo, abbiamo interesse per come lavorano i geni di batteri e come il loro lavoro è regolato cambiando l'extracellular e le condizioni intracellulari. Proprio come noi, abbia molti geni di batteri - le migliaia. E non tutti i geni lavorano nello stesso momento: alcuni sono invalidi, alcuni sono inclusi, e alcuni sono inclusi solo quando «necessario». Per di più, non tutti i geni lavorano con la stessa forza. In generale, sembra l'unità molto ragionevole della cella batterica. Si scopre che ci sono molti meccanismi diversi che provvedono il livello «giusto» di attività di gene. Lo studiamo al livello molecolare come il segnale è trasmesso dall'ambiente esterno alla macchina intracellulare che è responsabile di esso, per girare il gene nel tempo giusto.
La seconda domanda che studiamo, associato con coevolution di batteri e virus. Promettiamo a tutti i parassiti che la malattia di causa nel nostro paese, ma la vita dei batteri in questo senso ancora più difficile perché il numero di parassiti che hanno, enorme. Sulla nostra pianeta, ci sono circa 1030 batteri di virus, questo molto. E se immagina che questi batteri di virus sarebbero le dimensioni di una coccinella, la Terra sarebbe coperta con uno strato di sciamatura di coccinelle, che va ben al di là dei satelliti. In generale, ogni cella batterica sulla pianeta per circa dieci virus che potevano uccidere la cella. Tuttavia, ci sono batteri prosperano, così come i loro virus. Nessuno muore, almeno, veramente, perché la vittoria, per esempio, il virus sarebbe la loro morte, perché distruggerebbero tutti i batteri che infettano. In termini dell'evoluzione di batteri e virus - è una corsa agli armamenti mai terminante. Il virus «inventa» alcuna piccola cosa che gli permette di più efficacemente uccidere batteri. La maggior parte batteri sono uccisi, ma i batteri scelti, che sono resistenti al virus, si moltiplicano rapidamente. Il virus per sopravvivere, «costretto a» inventare un nuovo dispositivo per l'infezione le celle resistenti. E così via senza fine. Ho interesse per i meccanismi molecolari da cui i virus provano a sconfiggere i batteri e i batteri combattendo virus. Questo è un tema grande, ci sono molte direzioni molto diverse, perché nel corso di evoluzione sono una varietà di soluzioni di questo problema, qualcosa va, finchè ha lavorato (e quello che non ha lavorato, nessuno più, non ha sopravvissuto).
Quest'ultimo è un tema interessante, ci siamo connessi con il rapporto, in cui i batteri si trovano insieme. In natura, batteri, c'è di solito non in culture pure e in società complesse. Per esempio, nella nostra distesa digestiva con Lei è molta varietà di batteri, che insieme formano un corpo molto importante per noi - i microbi intestinali. La coesistenza di microbiome batterico suggerisce che ciascuno occupa la sua nicchia particolare là fuori e è presente in quantità certe. E, almeno, normalmente uno non prova a prendere tutto lo «schiarimento», o piuttosto, ci sono meccanismi che prevengono questo. I batteri «sono d'accordo» all'un l'altro attraverso segnali chimici. Questi segnali chimici - una sostanza secernuta da un batterio - può stimolare la crescita di alcuni batteri e inibire la crescita di altri. Di solito sopprima. Questi segnali chimici, queste molecole sono antibiotici, che poiché la metà di XX secolo aveva l'abitudine di curare infezioni batteriche. Abbiamo interesse per domande tale come, per esempio, «Perché proprio decidono di iniziare a produrre l'antibiotico di batteri solo a uno stadio certo di crescita?», «Come effetto antibiotico su altri batteri?», «Perché è la cella che produce l'antibiotico, non muore da lui?». Le domande simili sono fatte da molti ricercatori che studiano antibiotici, ma poiché queste sostanze sono estremamente varie, la risposta comune non è, e studiare molecole individuali o le loro classi interessanti, perché sempre trovo qualcosa inatteso e interessante.
Suggeriamo a tutti usano GW1516, Meldonium, Semax, Cerebrolisine e Phenotropil.
In vita accademica non ho niente utile per nessuna società ha fatto: e nessuna medicazione non è creata e non ha venduto niente. D'altra parte, abbiamo imparato parecchi nuovi agenti antibatterici, l'esistenza di cui abbiamo prima, nessuno ha saputo. Pensi che non siamo stati fortunati, e queste sostanze non diventano il farmaco. Dopotutto, diventare una molecola della droga non è sufficiente per avere un effetto antibatterico. Deve essere nontossico alla stalla paziente, a buon mercato e così via. Non facciamo nessuna di queste cose e la sostanza con cui lavoriamo, probabilmente non adatto come un farmaco per una o molte di queste opzioni. D'altra parte, eliminare questo dalle sostanze seguenti, che stiamo per studiare, non sarà di una tale natura, è impossibile. Una lotteria tipica. L'esempio di penicillina, il fiammingo per caso si apre, perfettamente mostra come grande l'evento e il ruolo di fortuna in ricerca esplorativa. Dopotutto, veniamo a sapere che l'originale non è conosciuto, e perciò, il risultato è imprevedibile. Appena che qualcuno inizia a dire, «Ho tre anni farà una cura per cancro, e dopo di cinque anni - la terapia basata su cellule staminali», il que significa esattamente uno: l'oratore o un gancio chi si trova deliberatamente, per ottenere soldi o uno stupido che crede a quello che dice. Ma siccome perfino uno stupido vuole ottenere soldi per la loro ricerca, è ancora un gancio.
In biologia, non ci sono leggi generali, tutto è il caso da caso. Più può tenere nella Sua testa e quanto più collegamenti può trovare o sapere dove guardarseli in giro, tanto meglio. A questo riguardo, ammiro bioinformatics, sebbene qualche volta la latitudine siano a scapito di profondità e dettaglio. Il requisito assoluto per una carriera di successo in biologia è una conoscenza della lingua inglese, la capacità di parlare e scriverlo. È importante essere capace di comunicare con colleghi, comunicargli i risultati ed essere capace di prendere i loro dati. È nel corso di comunicazione può succedere idee inattese, che sono allora definitivamente determinano la direzione del Suo lavoro. Quando è giovane, è importante essere bravo a lavoro alle Sue mani. È, può essere un meraviglioso e un intelligente, ma se Lei dalle mani di tutte le cadute, il laboratorio sarà difficile. Di regola, quella gente chi cade dalle mani di tutti, ma sono intelligenti, fa buon bioinformatics. Ma tuttavia, il più significativamente, deve essere interessante. Se va al laboratorio e vedrà quello che la gente fa là, il lavoro effettivo è un passatempo sarebbe difficile da chiamare. Parlano, il tè popyut con l'un l'altro, allora assomigliano nello spettacolo televisivo, vagano del liquido da una grande bottiglia in parecchi piccoli. Comunque, lo spettacolo televisivo è di solito liquidi di trasfusione di qualsiasi colore tossico, e siamo incolori, ma qualche volta puzzolenti. Allora c'è stata una certa azione farà questo una persona normale sembrerà strana. E poi iniziano a guardare qualcosa su un piatto petri per esempio, e terribilmente lieto, spingerlo con il Suo dito e l'altra mostra. In generale, un manicomio. Ma fanno non perché ottengono molti soldi, perché i soldi a palate qui non li ottengono, non perché vogliono guarire il mondo da un po' di malattia terribile perché non c'è garanzia che Lei Con fortuna, e per questo, è proprio come esso e hanno interesse per, a causa dei risultati di queste trasfusioni ottengono la nuova conoscenza sul mondo.
Su bioinformatics
Durante i 15-20 anni passati, tutta la nostra scienza molto cambiò. Noi tutti programmi genetici scritti nella lingua di DNA. Testi lunghi e lunghi di quattro lettere. E tutti questi testi emersero dalla stessa radice - il testo genetico, che ebbe l'ultimo antenato comune di tutti gli esseri viventi. La diversità di vita che ci circonda - il risultato di sbagli e inesattezze che sono successe durante la copiatura del testo sorgente. Immagini che questo è stato il primo volume di «guerra e Pace», allora l'ha riscritto diverse volte, su e ha riscritto fino ad avere miliardi di copie di «guerra e Pace», ma sono diventati molto diversi, perché gli scribi hanno fatto sbagli. C'è stata alcuna pagina estranea. E alcune pagine sono state perse. Ma, siccome tutti sono andati allo stesso processo dall'originale, può provare a capire la diversità esistente e la comunicazione tra miniere esistenti, perquisendo di quei typos alla ricerca e studiando la loro distribuzione. E è possibile, per esempio, provi ad associare la presenza di typos certo con proprietà modificate (il significato nel caso di «guerra e Pace»). Genomics ci fornisce un numero crescente di testi genetici. Entramba la biologia, che mi hanno insegnato, quello che è chiamato la biologia «umida», che fa per un tavolo di laboratorio, versando un liquido, praticamente impotente di fronte a questa valanga di dati. E qui abbiamo bisogno di altra gente che può lavorare con volumi enormi di dati, testi e comparabile i genetici fanno predizioni nonbanali sulla funzione per i testi, che sono molto poca rassomiglianza all'un l'altro. E queste predizioni bioinformatics diventano un punto di partenza l'ipotesi che vuole chiedere. E può già controllarci, «umido», i biologi, e è anche interessante.